Hệ vi sinh đường ruột có nhiều chức năng quan trọng. Quỹ đạo phát triển hệ vi sinh đường ruột hợp lý rất cần thiết cho nhiều khía cạnh sức khỏe lâu dài. Mặt khác, những xáo trộn trong quá trình phát triển hệ vi sinh phù hợp lứa tuổi liên quan đến các hệ quả sức khỏe khác nhau.